حسین نقوی حسینی و محسن کوهکن٬ دو تن از نمایندگان مجلس٬ نامه علی مطهری به مصطفی پورمحمدی٬ مبنی بر لزوم شفاف‌سازی درباره اعدام‌های سال ۶۷ را «بازی در پازل دشمن» و «تطهیر منافقین از تریبون مجلس» دانسته‌اند. ….

دیگربان:
حسین نقوی حسینی٬ سخنگوی کمیسیون امنیت ملی و سیاست خارجی مجلس گفته مطهری به عنوان نایب رئیس مجلس «نباید در هر شرایطی، هر حرفی بزند و اقدامی انجام دهد، چرا که ممکن است ضدانقلاب از این اقدامات سوء استفاده کنند.» وی نامه علی مطهری به وزیر فعلی دادگستری مبنی بر شفاف سازی در خصوص پرونده اعدام‌های سال ۶۷ را «به نوعی بازی در پازل دشمن» دانسته و افزوده «چنین اقداماتی واقعا جای سوال دارد.»

محسن کوهکن٬ نماینده لنجان در مجلس هم گفته «اجازه تطهیر منافقین از تریبون مجلس را نمی‌دهیم و اگر گفت و گو با اقای مطهری به نتیجه نرسد احتمال اینکه سراغ گزینه عزل برویم وجود دارد.» وی از اینکه سخنان و نامه یکی از اعضای هیات رئیسه مجلس به عنوان «مستند دشمنان» تبدیل شود٬ اظهار تاسف کرده است. کوهکن افزوده شکایت از مطهری به کمیته نظارت بر رفتار نمایندگان «به هیچ وجه موضوع اختناق نیست بلکه هدف آن است که از تریبون هیات رئیسه مجلس شورای اسلامی مواضعی گفته نشود که در مخالفت با بیانات رهبری و مصالح کشور است.»

انتشار فایل صوتی مخالفت صریح حسینعلی مطهری با اعدام‌های سال ۶۷ موجب شد که علی مطهری از مصطفی پورمحمدی که پیش‌تر هرگونه نقش در این اعدام‌ها را انکار می‌کرد٬ خواستار شفاف‌سازی شود. این اقدام با خشم نیروهای تندرو مواجه شده و خانواده روح‌الله خمینی نیز که امروزه به اصلاح‌طلبان نزدیک هستند٬ از اقدام بنیان‌گذار جمهوری اسلامی دفاع کرده‌اند.