محمدتقی مصباح یزدی که از او در رسانه‌های ایران به عنوان «پدر معنوی جبهه پایداری» نام برده می‌شود، با اشاره به علی خامنه‌ای، رهبر جمهوری اسلامی، گفت: «اگر خدای نکرده تار مویی از ایشان کم بشود چه کسی می‌تواند جای ایشان را بگیرد؟» ….

رادیوفردا:
به گزارش روز یکشنبه ۲۳ اسفند خبرگزاری ایسنا وی در ادامه گفت: «البته خزانه خدا خالی نیست. امام از دنیا رفت، ما تو سرمان می‌زدیم چه کسی می‌تواند جای ایشان را بگیرد. الحمدلله خدا از خزانه‌اش نعمتش را ارزانی داد. ما نمی‌شناختیم. خزانه خدا خالی نیست. اما آنچه که ما می‌شناسیم، جانشین مناسبی نمی‌شناسیم؛ لذا دعا می‌کنیم خدایا به طول عمر و عزت او تا ظهور حضرت ولی عصر بیفزا.»

آیت‌الله مصباح یزدی که در دفتر سعید جلیلی سخن می‌گفت با اشاره به علی خامنه‌ای اظهار کرد: «خاک بر سر منی که دستور بدهد این کار را بکن و من تمرد کنم. بفرمایند این کار را نکن، با کمال پررویی عکسش را عمل کنم. چقدر آدم می‌تواند پست بشود؟» وی در مورد اطاعت از علی خامنه‌ای افزود: «من و شما باید سعی کنیم این وظایف را در هر حالی خوب بشناسیم. آنچه می‌توانیم و قادریم، عمل کنیم. برای من چه ربطی داشته باشد، اصلاً تو چه داری؟ تو کی هستی؟ اگر می‌خواهی چیزی باشی، او باید تو را بالا ببرد. پس باید کاری کنی که او دوست دارد.» محمدتقی مصباح یزدی این سخنان را پس از آن بیان می‌کند که در انتخابات اخیرنتوانست به مجلس خبرگان رهبری راه بیابد و به همراه محمد یزدی، رئیس فعلی مجلس خبرگان، از این نهاد کنار گذاشته شد.

بر مبنای قانون اساسی ایران، مجلس خبرگان رهبری تنها نهادی است که وظیفه و اختیار انتخاب یا برکناری رهبر جمهوری اسلامی را بر عهده دارد.
دوره جدید مجلس خبرگان رهبری قرار است از روز هفتم خرداد سال ۹۵ کار خود را آغاز کند.
آیت‌الله خامنه‌ای در آخرین سخنان خود نبودن محمد تقی مصباح یزدی و محمد یزدی در پنجمین دوره مجلس خبرگان رهبری را یک «خسارت» برای این مجلس توصیف کرده است.
رهبر جمهوری اسلامی روز ۱۹ دی با نام بردن از مجلس خبرگان رهبری به عنوان «مجلسی مهم»، گفته‌بود: «مجلس خبرگان بناست آن روزی که رهبر فعلی نباشد یا رهبر نباشد آن‌وقت آن‌ها رهبری را انتخاب کنند که جلوی هجمه دشمن بایستد، شجاعت نشان بدهد، راه امام را ادامه بدهد.»
وی روز ۲۰ اسفندماه اما در دیدار با اعضای مجلس خبرگان رهبری توصیه کرد که در انتخاب رهبر آینده «رودربایستی و مصلحت‌اندیشی» در کار نباشد.

ادامه انتقاد تند مصباح از کسانی که «سعی می‌کنند به دشمنان نزدیک شوند» محمد تقی مصباح یزدی روز پنج‌شنبه ۲۰ اسفند، دولت حسن روحانی را متهم کردکه می‌خواهد از طریق «نوکری آمریکا» باعث پیشرفت کشور بشوند و افزود که «آن‌ها عنوان می‌کنند که برای رسیدن به زندگی بهتر باید به کشوری مانند آمریکا تبدیل شویم.» به گزارش ایسنا، آیت‌الله مصباح یزدی روز یک‌شنبه نیز به این واکنش‌های خود ادامه داده و گفت: «ای کسانی که سعی می‌کنید به دشمنان نزدیک بشوید تا آنها یک لبخندی به شما بزنند، اینها پست‌ترین جنبندگانند. نوکری اینها افتخار ندارد، خجالت بکشید.» مدیر مؤسسه پژوهشی امام خمینی افزود: «طرف حاضر می‌شود ارزش هفتاد هشتاد میلیون اهل کشور خودش را تسلیم یک دشمن کند، برای اینکه چند روز بیشتر روی این صندلی بنشیند. پست‌تر از این چه چیزی هست؟»
مصباح یزدی خرج کردن پول «در راه خدا»، زندان رفتن و «به شهادت رسیدن» را از «نعمت‌های الهی» دانسته و گفت: «اینها را چه کسی به دست ما داده است؟ ثانیاً چه کسی توفیق داد این امانت را در این راه مصرف کنیم؟ مگر هر کسی چنین توفیقی نصیبش می‌شود؟» او افزود: «افراد زیادی بودند که این نعمت‌های الهی را در راه شیطان صرف کردند و بنده شیطان شدند. نمونه‌هایش را هم در جامعه می‌بینیم، حالا اسم نمی‌خواهم ببرم. خدا بر تو منت گذاشت که پست‌تر از گاو و خر نشوی.» محمدتقی مصباح یزدی با سیاست‌های دولت روحانی برای رفع تحریم‌ها در ازای محدود کردن برنامه هسته‌ای به‌شدت مخالف است اما حسن روحانی، رئیس‌جمهوری ایران با اشاره به خسارت‌های مالی تحریم‌ها بر مزایای این سیاست تأکید می‌کند.